De acuerdo con las propiedades farmacológicas de esto fármacos los podríamos clasificar en:
1.Inhibidores no selectivos de las ciclooxigenasas: todos los fármacos AINE clásicos.
2.Inhibidores selectivos de la COX-2: únicamente los denominados COXIB mantienen esta selectividad a dosis terapéuticas.
3.Inhibidores selectivos de la COX-1: únicamente la aspirina a bajas dosis ha demostrado esta selectividad.
Además de las diferencias señaladas, los fármacos se han clasificado tradicionalmente por su estructura química, pero este aspecto tiene escasa relevancia terapéutica, excepto tal vez en los aspectos relacionados con las reacciones alérgicas a estos fármacos.
Otro aspecto importante a tener en cuenta es la vida media de estos fármacos; un aspecto que debe conocerse a la hora de decidir la posología de cada uno de los compuestos. Existen formas de liberación retardada de la mayoría de los fármacos de vida media-corta que permiten su administración en una o dos tomas al día, un aspecto importante para garantizar un buen cumplimiento terapéutico.