Controla e integra la actividad del Sistema Nervioso Autónomo.
Produce las hormonas, incluidas las hormonas liberadoras, las inhibidoras, la oxitocina y la antidiurética.
Regula los patrones del comportamiento y emocionales (junto con el Sistema Límbico).
Contiene los centros de la alimentación y la saciedad (regulan la ingesta de alimentos), el centro de la sed (regula la ingesta de líquido) y el ritmo circadiano.
Controla la temperatura corporal al actuar como termostato del cuerpo.